1、用途不同。雖然二者都是用于國家建設，參與政府資金周轉的，專項債券具有固定的投資方向和投資項目，不能隨意用于其他地方，但一般債券的范圍更廣，投資更多元化。2、承擔風險不同。雖然二者都是政府債券，由政府背書，但是從收益的安全性看，地方債一般債的償還來源是財政收入，安全性要高于專項債債券。3、償還途徑不同。專項債券的償還途徑地方是項目建成后取得的收入作為保證；一般債券的償還途徑一般是地方政府以本地區的財政收入作為擔保。